Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mmp20P57748 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mmp20P57748 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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