Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NcstnP57716 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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NcstnP57716 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NcstnP57716 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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