Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cd38P56528 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms