Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Rab4aP56371 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rab4aP56371 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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