Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rrp1P56183 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rrp1P56183 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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