Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CebpaP53566 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CebpaP53566 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CebpaP53566 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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