Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
VdrP48281 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VdrP48281 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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