Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PtgfrP43117 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms