Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtlP38585 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TtlP38585 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TtlP38585 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms