Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rab20P35295 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms