Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Rab5cP35278 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab5cP35278 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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