Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptk2P34152 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms