Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Nedd1P33215 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms