Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VtnP29788 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
VtnP29788 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms