Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RxrgP28705 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RxrgP28705 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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