Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RxrbP28704 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxrbP28704 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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