Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RxraP28700 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RxraP28700 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RxraP28700 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RxraP28700 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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