Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Psmb9P28076 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms