Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lef1P27782 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lef1P27782 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms