Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PdgfraP26618 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PdgfraP26618 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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