Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gata3P23772 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gata3P23772 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms