Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hoxd8P23463 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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