Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NefhP19246 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NefhP19246 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NefhP19246 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms