Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lama1P19137 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms