Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Gata1P17679 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms