Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RhoP15409 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RhoP15409 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RhoP15409 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RhoP15409 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RhoP15409 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms