Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lmnb1P14733 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lmnb1P14733 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms