Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Cxcl1P12850 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cxcl1P12850 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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