Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Hoxd4P10628 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms