Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxa6P09092 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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