Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Itgb1P09055 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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