Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hoxd3P09027 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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