Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Spta1P08032 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Spta1P08032 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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