Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01643 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01643 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01643 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P01643 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01643 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01643 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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