Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cfdp1O88271 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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