Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vamp4O70480 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vamp4O70480 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms