Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BckdkO55028 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BckdkO55028 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BckdkO55028 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BckdkO55028 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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BckdkO55028 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BckdkO55028 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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