Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf13O54965 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf13O54965 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf13O54965 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf13O54965 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf13O54965 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf13O54965 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf13O54965 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Rnf13O54965 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf13O54965 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf13O54965 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf13O54965 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf13O54965 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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