Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ptpn9O35239 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms