Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Casq1O09165 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Casq1O09165 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Casq1O09165 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casq1O09165 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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