Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LfngO09010 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
LfngO09010 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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