Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CckarO08786 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CckarO08786 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms