Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sema3aO08665 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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