Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Sec22bO08547 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sec22bO08547 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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