Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Efna3O08545 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Efna3O08545 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Efna3O08545 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Efna3O08545 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Efna3O08545 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Efna3O08545 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Efna3O08545 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms