Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm2888K7N746 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms