Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm379J3QQ19 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms