Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm5849J3QPE5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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