Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm5294J3QP53 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm5294J3QP53 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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