Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm21976J3QNN2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm21976J3QNN2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms